Diversidad taxonomía y filogenia de los grupos bradyrhizobium sp. (chamaecytisus) y bradyrhizhobium sp. (lupinus). Catabolismo del ácido indol-3-acético por bacterias del género bradyrhizobium

Abstract

En la tesis se estudia la biodiversidad genotípica y fenotípica de poblaciones rizobianas aisladas de cinco especies de leguminosas arbustivas endémicas de Canarias y de varios géneros de Lupinus y Omithopus de orígenes geográficos muy diversos. La primera parte de la tesis se dedica al estudio taxonómico y filogenético de estos rizobios. La caracterización de los aislados mediante análisis de polimorfismo de los fragmentos de restricción y la secuenciación del gen de ARN ribosomal 16S incluyeron a todos los aislados en el género Bradyrhizobium dentro del linaje Bradyrhizobium japonicum-Rhodopseudomonas palustris. La filogenia del ARNr 16S resolvió tres grupos diferentes de aislados: el denominado grupo BGA1 resultó muy próximo a la especie B.japonicum, de manera que los aislados de este grupo podrían pertenecer a esta especie; el grupo BTA1 contiene a la mayoría de los aislados (el 60%) y éste y otros análisis apuntan que este grupo puede representar una nueva especie para el género Bradyrhizobium; por último, el grupo BES5 presentó también características que los diferencian de las otras especies del género y, a la espera de una mayor caracterización, podría representar también una nueva especie. Estas propuestas se vieron apoyadas por un análisis de perfiles electroforéticos de los ARNs de bajo peso molecular (ARNr 5S y ARNts) al resolver básicamente los mismos grupos que los establecidos con el gen ADNr 16S. El análisis de la región intergénica 16S-23S y la estructura del genoma revelada por los perfiles obtenidos a partir de oligonucleótidos de secuencias. ERIC mostraron una alta diversidad dentro de cada grupo 16S, sin encontrarse en general correlación entre los distintos análisis. La región intergénica mostró cierta correlación con la planta hospedadora, diferenciando cada uno de los grupos 16S en dos subgrupos en función de un tipo de planta. La filogenia de la región simbiótica co