Taxonomía, sistemática y filogenia de la familia syllidae (annelida, polychaeta)

  1. María Teresa Aguado Molina
Supervised by:
  1. Guillermo San Martín Peral Director

Defence university: Universidad Autónoma de Madrid

Year of defence: 2008

Committee:
  1. Daniel Martín Mayorga Chair
  2. Eduardo López Secretary
  3. Adriana Giangrande Committee member
  4. Jorge Núñez Fraga Committee member
  5. Mark E. Siddall Committee member

Type: Thesis

Abstract

ÍNDICE Pág. Agradecimientos.............................................................................1-4 INTRODUCCIÓN.............................................................................5-54 Los sílidos y esta tesis doctoral...........................................................7 I. La Familia Syllidae Grube, 1850....................................................9-28 1. Hábitat y alimentación 2. Plan morfológico 3. Reproducción 4. Taxonomía 5. Filogenia II. La inferecia filogenética o Cladística...........................................29-48 1. Conceptos básicos 2. Las metodologías filogenéticas. 2.1. Los métodos de distancias 2.2. Los métodos discretos 3. El análisis de Parsimonia 3.1. Construcción de Cladogramas 3.1.1. La elección de los taxones 3.1.2. Codificación de caracteres 3.1.3. Alineamiento de las secuencias 3.1.4. Criterios de optimización. 3.2. Búsqueda del árbol más parsimonioso 3.2.1. Algoritmos exactos 3.2.2. Algoritmos heurísticos. 3.3. Árbol de consenso 3.4. Estadísticos descriptivos 3.5. Pesado de caracteres Índice 3.6. Grado de soporte de los clados de los árboles obtenidos 3.7. Combinación de datos de distinta naturaleza 3.8. Críticas al análisis de parsimonia III. Organización de la tesis ..........................................................49-54 OBJETIVOS DE LA INVESTIGACIÓN ...............................................55-58 Objectives MATERIAL Y MÉTODOS .................................................................59-62 1. Material 2. Métodos 2.1. Metodología de campo 2.2. Metodología de laboratorio 2.3. Metodología filogenética RESULTADOS..............................................................................65-468 BLOQUE I. ESTUDIO TAXONÓMICO DE LA FAMILIA SYLLIDAE 1. Sílidos intersticiales (Syllidae: Polychaeta) del Parque Nacional de Coiba (Pacífico, Panamá). Aguado, M.T. & G. San Martín. 2006. Revista de Biología Tropical......................................................................................65-84 2. Two New Species of Syllidae (Annelida: Polychaeta) from Japan. Aguado, M.T, San Martín, G. & E. Nishi. 2006. Scientia Marina...................................................85-92 3. Syllidae (Polychaeta) from Japan with the descriptions of three new species. Aguado, M.T., San Martín & Nishi. Submitted. Systematics and Biology................93-156 4. A new species of Opisthosyllis (Polychaeta: Syllidae) from California (U.S.A.). Aguado, M.T; San Martín, G. & Nygren, A. 2005. Zootaxa.........................157-168 Índice 5. Syllidae (Annelida: Polychaeta) from Indonesia collected in the Siboga (1899-1900) and Snellius II (1984) expeditions. Aguado, M.T., San Martín, G. & Ten Hove, H. In press. Zootaxa...............................................................169-240 6. Syllidae (Polychaeta) from Lebanon with two new reports for the Mediterranean Sea. Aguado, M.T. & San Martín, G. 2007. Cahiers de Biologie Marine....241-258 BLOQUE II. REVISIÓN DE GÉNEROS DE LA FAMILIA SYLLIDAE 1. Re-description of some enigmatic genera of Syllidae (Phyllodocida: Annelida). Aguado, M.T. & San Martín, G. In press. Journal of Marine Biological Association of United Kingdom.........................................................................261-304 BLOQUE III. ESTUDIO FILOGENÉTICO DE LA FAMILIA SYLLIDAE 1. Phylogeny of Syllidae (Polychaeta) based on combined molecular analysis of nuclear and mitochondrial genes. Aguado, M.T., Nygren, A. & Siddall, M. E. 2007. Cladistics................................................................................307-320 2. Phylogeny of Syllidae (Phyllodocida, Annelida) based on morphological data.......................................................................................321-384 BLOQUE IV. NUEVA PROPUESTA DE CLASIFICACIÓN 1. A proposal of classification of the family Syllidae Grube, 1850 with a new subfamily, keys of identification and diagnoses for all valid genera.....................387-468 DISCUSIÓN...........................................................................469-482 Los avances en taxonomía Los avances en sistemática CONCLUSIONES.......................................................................483-492 1. Conclusiones taxonómicas 2. Conclusiones de la revisión de géneros enigmáticos en la familia 3. Conclusiones en cuanto a las relaciones filogenéticas 4. Conclusiones sistemáticas Conclusions 1. Taxonomic conclusions 2. Conclusions to the revision of enigmatic genera 3. Phylogenetic conclusions 4. Sistematic conclusions Trabajos futuros............................................................................493 BIBLIOGRAFÍA...........................................................................495-510 ANEXOS....................................................................................511-516