Aplicación de marcadores moleculares para cribado de QTLs en diferentes fuentes de resistencia a tizón tardío (Phytophthora infestans) en papa
- GABRIEL ORTEGA, JULIO LUIS
- Enrique Ritter Director/a
- José Ignacio Ruiz de Galarreta Gómez Codirector/a
Universitat de defensa: Universidad Pública de Navarra
Fecha de defensa: 07 de de maig de 2009
- Antonio Gandarillas President/a
- Inmaculada Farran Blanch Secretari/ària
- Domingo Ríos Mesa Vocal
- Salomé Prat Vocal
- Amaia Ortiz Barredo Vocal
Tipus: Tesi
Resum
En el presente estudio fueron analizados y genotipados progenies resistentes a Phytophthora infestans, derivados del cruzamiento entre especies silvestres (oka, can, buk, jam y rap) y especies cultivadas diploides de papa (phu, gon and dih tbr). Diferentes niveles de resistencia al oomycete P. infestans en hojas y tubérculos fueron encontrados en las cinco progenies evaluadas. El análisis de co-localización entre los marcadores SSR y QTLs posicionados publicados para resistencia a P. infestans reveló 28 marcadores SSR ligados y localizados en los 12 cromosomas de papa. Por otra parte suficientes variaciones en los niveles de resistencia se han obtenido dentro d ela progenie de todas las fuentes de resistencia, lo que permitió un eficiente análisis de QTL. La selección de QTLs para resistencia a P. infestans en hojas a través de marcadores SSR reveló que en la progenie D (can x phu), sólo un QTL fue detectado en el cromosoma VIII, que desciende de phu. En la progenie E (buk x phu) se ha detectado cuatro QTL seleccionables ubicado en los cromosomas III, V, Vi y X. Sólo uno en el cromosoma III descendiente de can. En la progenie G (jam 27521.48 x gon) se detectaron tres QTLs seleccionables en los cromosomas III, VI y VII de acuerdo a los valores de significancia. QTAlelos significativos fueron observados en los cromosomas VI para el parental gon, y dos lugares en el otro progenitor (jam). Algunos marcadores SSR no mostraron segregación de alelos SSR en la población, a final de que no fue posible evaluar los correspondientes lugares genómicos. La selección de QTL también se realizó para tubérculo de P.infestans en tres poblaciones. El análisis de correlación de los niveles de infección de hoja y tubérculo fueron bajos (-0.069 a 0.328) y no significativos. Esto también se reflejó en QTLs detectados en cada población de resistencia en tubérculos. En la población G fueron detectados tres QTLs seleccionables. El QTL en el cromosoma VI que desciende del parental gon es común para resistencia en tubérculo y hojas. Los otros dos QTLs se encuentran en los cromosomas X y V y descienden de jam y gon, respectivamente. En la población D el QTL de phu en el cromosoma VIII fue común para P.infestans de tubérculo y hoja. Además, fue detectado un QTL en el cromosoma XI a partir del gen candidato BS2 que puede coincidir con el QTL Pi-11 publicado. Se ha creado una -impresión genotípica- de cada uno de los parentales (QTA genotyping), indicando las posiciones de QTL seleccionables y los correspondientes marcadores moleculares SSR para la selección asistida para marcadores (SAM) en diferentes progenies. Estos marcadores pueden ser aplicados en los programas de fitomejoramiento de papa para todos los cruzamientos que involucran el correspondiente genotipo parental como fuente de resistencia.