Epidemiology and phyologeny of Vibrio vulnificus biotype 2

Résumé

Vibrio vulnificus es una bacteria gram negativa, heterogénea de ambientes marinos y salobres. La especie esta constituida por cepas avirulentas y virulentas para el hombre o peces que se aíslan del ambiente o de muestras clínicas. Basado en varias diferencias fenotípicas, la especie se subdivide en tres biotipos; el biotipo 1 esta formado por aislados ambientales (agua, marisco...) y muestras clínicas humanas asiladas alrededor del mundo, el biotipo 2 son muestras clínicas aisladas de peces y unas pocas humanas (aislados de la serovariedad E) con una distribución mundial. Y el biotipo 3 son muestras clínicas de brotes infecciosos en humanos limitados geográficamente a Israel. No obstante, esta clasificación no refleja la verdadera situación de la especie dado que los caracteres usados para el biotipado no son validos cuando se intenta caracterizar los nuevos aislados. El objetivo de este trabajo fue analizar la verdadera estructura de la especie así como las relaciones entre los aislados de los diferentes biotipos. Para este propósito, primero incrementamos nuestra colección de cepas de V. vulnificus de los tres biotipos aislados de diferentes muestras y orígenes geográficos. Hemos centrado el trabajo en el biotipo 2 de la especie puesto que tiene gran incidencia en al anguilicultura en España. Este biotipo era considerado un patógeno obligado debido a la ausencia de aislados ambiental, pero trabajos publicados por nuestro grupo demostraron que este patógeno puede sobrevivir en el agua durante largos periodos de tiempo. Nuestro primer objetivo fue, por lo tanto, el desarrollo de un protocolo especifico de aislamiento de muestras ambientales del biotipo 2. Usando suero de anguila en un tampón salino fuimos capaces de aislar el biotipo 2 de diferentes muestras de agua y de anguilas sanas. En paralelo con este estudio, realizamos una comparación genómica (Técnica SSH) entre cepas del biotipo 1 y del 2 intentando encontrar algún loci genético