Construcción de un mapa genético funcional y detección de genes de resistencia frente a factores bióticos en patata (solanum tuberosum l.)

Zusammenfassung

El trabajo desarrollado en los diferentes capítulos de esta tesis, ha pretendido la construcción de un mapa funcional contribuyendo, de esta manera, el estudio genético de la patata y a mejorar la integración de la información disponible en un mapa de referencia, el mapa ultra denso de patata (mapa UHD). Esto ha sido posible gracias a la construcción del mapa del transcriptoma, formando por un total de 696 marcadores moleculares que se integraron en el mapa UHD. Además, en este mismo mapa se integraron un total de 184 QTLs/genes para diferentes caracteres publicados en patata como resistencias, calidad y otros. La unificación de toda esta información en un único mapa, posibilitó la asociación de 73 QTLs de resistencia frente a diferentes patógenos con 144 marcadores moleculares (TDFs) en el mapa ultra denso de patata. De estos 144 TDFs, se analizaron las secuencias de 36, 15 de ellos representaron posibles marcadores candidato para la detección de genes de resistencia a diferentes factores bióticos y 9 TDFs no mostraron ningún tipo de homología en los análisis en las bases de datos utilizadas, pudiendo ser posibles genes de resistencia hasta la fecha sin describir. Por otro lado, se aplicaron novedosas técnicas (BSA-cDNA-AFLP, cDNA-AFLP diferencial y análisis de microarrays) en el análisis de la expresión del genoma de especies silvestres afines a la patata y resistentes, con el propósito de estudiar el alcance de estas técnicas y de asociar genes con la resistencia cuantitativa a G.pallida. Además de analizar las variantes alélicas de estos genes candidato, también se integraron en el mapa UHD posiblitando de esta manera, la relación entre genes y expresiones fenotípicos y como consecuencia la asociación de funciones a los genes.