Construction of a functional genetic map and detection of candidate genes for useful traits in oil palm, elaeis guineensis jacq

  1. Javier Herrero Pedrero
Dirigée par:
  1. Enrique Ritter Directeur/trice

Université de défendre: Universidad del País Vasco - Euskal Herriko Unibertsitatea

Année de défendre: 2013

Jury:
  1. José María Carrillo Becerril President
  2. Maria de los Angeles Martinez de Pancorbo Gomez Secrétaire
  3. José María Becerril Soto Rapporteur
  4. Salomé Prat Rapporteur
  5. Domingo Ríos Mesa Rapporteur

Type: Thèses

Teseo: 116157 DIALNET

Résumé

El presente proyecto de tesis tiene por objeto la construcción de un mapa deltranscriptoma de una población de referencia de palmera de aceite (Elaeis guineensis,Jacq). Para ello, se utilizó la técnica molecular cDNA-AFLP (complementary DNAAmplifiedFragments Length Polymorphism). La población de ensayo consta de 116palmeras que descienden del cruce entre dos palmeras de características favorables parael cultivo. En una primera fase, mediante la técnica cDNA-AFLP se consiguenamplificar secuencias de ADN complementario consiguiendo fragmentos derivados deltranscriptoma (TDFs) en la población de mapeo. Los TDFs que presenten polimorfismoy segreguen en esta progenie serán utilizados para la construcción del mapa genéticofuncional.Este mapa del transcriptoma será integrado en el mapa genómico ya publicadodel mismo cruce de palmera en el que aparecen mapeados locus de carácter cuantitativoo QTLs (Quantitative Trait Loci). Los QTLs son relevantes ya que se consiguen tras elanálisis de caracteres que tienen interés agronómico. De esta manera se puede analizarsi existe relación entre los nuevos marcadores moleculares producidos y QTLs deinterés agronómicos o con genes asociados.Así mismo, se aplicó de la técnica cDNA-AFLP diferencial en muestras depalmera provenientes de distintos ensayos de campo para la detección de genescandidatos asociados con caracteres útiles. Se aislaron TDFs diferencialmenteexpresados en condiciones de sequía, para el incremento de longitud del tronco y endistintas fases del desarrollo del fruto. Estos genes candidatos se testaron en lapoblación de referencia para su mapeo y análisis de relación con QTLs.