RIM-ONE: base de datos de retinografías para la evaluación de métodos de segmentación del nervio óptico

  1. F. Fumero 1
  2. S. Alayón 1
  3. J.L. Sánchez 1
  4. J. Sigut 1
  5. M. González-Hernández 2
  1. 1 Universidad de La Laguna
    info

    Universidad de La Laguna

    San Cristobal de La Laguna, España

    GRID grid.10041.34

  2. 2 Hospital Universitario de Canarias
    info

    Hospital Universitario de Canarias

    San Cristóbal de La Laguna, España

    GRID grid.411220.4

Proceedings:
Jornadas de Automática (32ª.2011.Sevilla)

Publisher: Comité Español de Automática CEA-IFAC ; Universidad de Sevilla

ISBN: 978-84-694-6454-0

Year of publication: 2011

Type: Conference paper

Export: RIS

Abstract

El objetivo de este trabajo es ofrecer una base dedatos de imágenes de referencia en el campo de laoftalmología, diseñada específicamente para elestudio del glaucoma. Una de las tareas másimportantes en este campo de investigación eslocalizar, detectar y segmentar adecuadamente lacabeza del nervio óptico (CNO). En consecuencia, sehan propuesto muchos métodos de segmentación dela CNO en la literatura. El problema presente enestos momentos es que no hay un método estándar deevaluación de resultados para todos estos métodos.En este trabajo se proporcionan imágenes deretinografías de ojos sanos y con glaucoma endistintas fases de desarrollo junto con lassegmentaciones precisas de la CNO de cada caso, yse propone un procedimiento de evaluación de lasmismas para permitir la evaluación y comparaciónde resultados de los métodos automáticos diseñadospara la detección del glaucoma.

Bibliographic References

  • A. Hoover and M. Goldbaum, “Locating the Optic Nerve in a Retinal Image Using the Fuzzy Convergence of the Blood Vessels”, IEEE Transactions on Medical Imaging, vol. 22, 2003, pp. 951 -958.
  • B. Al-Diri, A. Hunter, D. Steel, M. Habib, T. Hudaib, and S. Berry, “REVIEW - a reference data set for retinal vessel profiles”, Conference Proceedings of the International Conference of IEEE Engineering in Medicine and Biology Society, vol. 2008, 2008, pp. 2262-2265.
  • C.A. Lupascu, D. Tegolo, and L.D. Rosa, “Automated Detection of Optic Disc Location in Retinal Images,” 21st IEEE International Symposium on Computer-Based Medical Systems, 2008, pp. 17-22.
  • Cancer Image Reference Database, http://cir.ncc.go.jp/en/index.html
  • Chrástek R, Wolf M, Donath K, Niemann H, Paulus D, Hothorn T, Lausen B, Lämmer R, Mardin CY, Michelson G., “Automated segmentation of the optic nerve head for diagnosis of glaucoma”, Med Image Anal., 9(4), 2005, pp. 297-314.
  • E.J. Carmona, M. Rincón, J. García-Feijoo and J. M. Martínez-de-la-Casa, “Identification of the optic nerve head with genetic algorithms”, Artificial Intelligence in Medicine, Vol. 43(3), 2008, pp. 243-259.
  • EyeText – Global Ophtalmic Community, http://www.eyetext.net
  • Fenimore, C., Armato, S., Aberle, D., Brown, M., Henschke, C., McNitt-Gray, M., MacMahon, H., McLennan, G., Meyer, C.R., Reeves, A.P., Yankelevitz, D.F., “The Lung Image Database Consortium (LIDC) and Image Database Resource Initiative (IDRI): A Completed Reference Database of Lung Nodules on CT Scans”, Medical Physics, Vol. 38, Issue 2, 2011, pp. 915 – 931.
  • Health Education Assets Library, http://www.healcentral.org/
  • Hospital Clínico San Carlos, Madrid, Spain, http://www.madrid.org/cs/Satellite?pagename= HospitalClinicoSanCarlos/Page/HCLN_home
  • Hospital Universitario de Canarias, Tenerife, Spain, http://www.huc.es
  • Hospital Universitario Miguel Servet, Zaragoza, Spain, http://sectorzaragozados.salud.aragon.es/index.p hp/mod.menus/mem.opcionesMenuNivel4/relm enu.93
  • J. Staal, M.D. Abràmoff, M. Niemeijer, M.A. Viergever, and B. Van Ginneken, “Ridge-based vessel segmentation in color images of the retina”, IEEE Transactions on Medical Imaging, vol. 23, 2004, pp. 501-509.
  • Kauppi, T., Kalesnykiene, V., Kamarainen, J.- K., Lensu, L., Sorri, I., Uusitalo, H., Kälviäinen, H., Pietilä, J., “DIARETDB0: Evaluation Database and Methodology for Diabetic Retinopathy Algorithms”, Technical report, 2006.
  • Kauppi, T., Kalesnykiene, V., Kamarainen, J.- K., Lensu, L., Sorri, I., Raninen A., Voutilainen R., Uusitalo, H., Kälviäinen, H., Pietilä, J., “DIARETDB1 diabetic retinopathy database and evaluation protocol”, Technical report, 2007.
  • Lowell J., Hunter A., Steel D., Basu A., Ryder R., Fletcher E., Kennedy L., “Optic Nerve Head Segmentation”, IEEE Transactions on Medical Imaging, Vol. 23, No. 2, 2004, pp. 256-264.
  • Medical Image Reference Center – Cardiovascular, http://subaru.medirec.ncvc.go.jp/
  • MedPix – Medical Image Database, http://rad.usuhs.edu/medpix/medpix.html?mode =default
  • Merickel, M.B., Abràmoff, M.D., Sonka, M., Wu, X., “Segmentation of the Optic Nerve Head Combining Pixel Classification and Graph Search”, Proc. SPIE 6512, 651215 (2007); doi:10.1117/12.710588
  • M. Usman Akram, Aftab Khan, Khalid Iqbal, Wasi Butt, “Retinal Images: Optic Disk Localization and Detection”, Image Analysis and Recognition, vol. 6112, 2010, pp. 40-49.
  • Zhang Z., Yin F.S., Liu J., Wong W.K., Tan N.M., Lee B.H., Cheng J., Wong T.Y., “ORIGA -light : An Online Retinal Fundus Image Database for Glaucoma Analysis and Research”, 32nd Annual International Conference of the IEEE EMBS, 2010.